教者竟达到了千余人之多，其后沙勿略离开平户前往京都，而把另一传教士托雷斯留在了当地。
随着平户的天主教徒不断增多，对此十分反感的佛教徒们开始不断寻衅滋事, 而领主松浦隆信未加干涉, 暗地里可能还有些放纵，这导致双方的对立情绪日益加深。
永禄四年（1561）八月，一些葡萄牙水手与平户町民发生冲突，结果船长及以下十四人被杀，酿成了最初的涉外暴力事件，而松浦氏在此后的裁决更令葡方大感不满，遂干脆断绝了与平户的贸易往来。
大村纯忠应葡萄牙人的要求将横瀬浦开港。横濑浦位于西彼杵半岛北端，与东彼杵之间隔了一个名叫针尾的小岛，其西南端被称为针尾濑户的海峡沟通了日本海和大村湾，附近海域的旋涡潮流是着名的景观。
同时有马义贞（大村纯忠之兄）将口之津作为贸易港开港。
大村氏是九州肥前国彼杵郡的领主，大村纯忠是上一代家主纯前的外甥。
岛原有马氏在有马晴纯担任当主时，势力已遍及高来、藤津、杵岛、彼杵、松浦等肥前五郡，同时还不断以养嗣子政策吞并、压服周边势力。
出生于天文二年的晴纯次子胜童丸，由于其母即大村纯尹之女、也就是纯前之妹，故于天文十九年做了大村家的养嗣子，讳纯忠，通称民部大辅、丹后守。
大村氏实际上属于有马家的附庸，全盛时期的有马家占据肥前国六郡之地，拥兵两万。
而肥前国另外五郡则是龙造寺家的势力范围。
虽然说大村纯忠在横濑浦开港，并且给了葡萄牙人很大的优惠，比如允许葡萄牙人传教，将附近的佛教徒迁走，甚至自己也信教。
但是这就引起了家中臣子以及佛门的不满，后面也就发生了叛乱，大村纯忠窘迫到没有侍从跟随，一个人带刀翻出居馆，在一个佛教武僧的保护下逃离大村。
后来叛乱被平定，但是横濑浦的港口在暴乱中被烧成白地。
葡萄牙商船一度被迫重回松浦氏领内的平户入港，但双方很快在永禄八年（1565）八月再度闹翻，于是便又折向大村领内的福田浦入港。
然而，福田浦外风高浪急、船只停泊困难，还时常要受到怀有敌意的松浦氏的袭击。葡人的目光于是转向了更深处的深江浦、亦即长崎港。
不过长崎开港一事也是许多波折，大村纯忠因为横濑浦一事心有余季不敢答应，后来还是在有马义贞的劝说，以及那丰厚的贸易利润下才答应
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