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事件的余波，却如海啸般席卷了整个世界。
首先便是各国高层以及依附于SEELE的社会各界精英大量死亡，直接导致了全球范围内的权力真空与社会大混乱。
而更可怕的是，在这次短暂冲击的影响下，地球的生态系统遭受了毁灭性的打击，海洋被彻底染成了象征死亡的红色，空气中都弥漫着浓郁的血腥气味。
在这样一片末世般的景象中，张启回归并迅速控制了NERV的局面。
他向全世界公布了从SEELE那里获取的所有机密资料，将这场灾难的全部责任，都推到了这个妄图成神的秘密组织身上。
随后的联合国紧急大会上，面对着一群惊魂未定的各国代表，张启以救世主的姿态，详细“说明”了事件的始末。
他宣称，造成这一切的，是SEELE与碇源堂的阴谋，而他在最后关头阻止了真正的末日。
同时，他发表了相关的技术论文，声称通过对莉莉丝残骸的研究，人类有能力重新构建地球的生物圈。
尽管这一切都只是张启的一面之词，但在碇源堂与SEELE成员全部“消失”的当下，已无人能够去探究背后的真相。
更何况，对于劫后余生的人类而言，稳定民心与灾后重建，远比所谓的真相更加重要。
很快，所有国家达成了共识。
他们将一切罪责归于SEELE，并向全世界宣布，人类将团结一切可以团结的力量，共同恢复地球。
为了表达决心，各国放弃了私有武装力量，共同组建起一支统一受联合国调遣的“地球防卫军”。
而NERV，则被改组为“地球生态重建与进化研究所”，旨在通过对EVA技术的研究，重新构建地球生态。该项目的总负责人，由张启担任。
……
因为使徒的威胁已经彻底消失，碇真嗣、绫波丽等EVA驾驶员，也终于卸下了沉重的担子，恢复了普通学生的身份。
走在第三新东京市重建的街道上，碇真嗣总有一种不真实的感觉。
当他收到父亲的死讯时，内心甚至没有泛起太大的波澜。
对于那个如同陌生人一般的父亲，他的死，似乎只是一则与自己关系不大的新闻。
反倒是偶尔能见到张启，让他感到一丝莫名的安心。
只是，明日香的情况有些特殊。
她在与使徒的战斗中，精神与EVA的同步率过高，
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