互相制约，确保军权牢牢地抓在皇帝个人的手中。
其实五军都督府和兵部存在并不矛盾，朱元璋对两个机构的职能作为极其细致的划分，兵部在军队中有任免将领、升调、训练军队的权力，但不能统帅军队打仗。而五军都督府虽然有统兵作战、管理屯田、掌管军籍、推选将领的职能，但五军都督府没有调遣军队的权力。
兵部和五军都督府的职责分工明确，朱元璋的整合，将军队的大权牢牢地抓在皇帝个人的手中。这对朱元璋加强皇权，尤其是加强皇帝对军队的绝对掌控具有巨大的现实意义。
不得不说，朱元璋或许在治国方面稍弱一点，但是在对军队的把握上面极为精准！五军都督府的设计就当时的情况来说是一个好到不能再好的办法了，绝对能保持军队和国家的稳定。
但是朱元璋死后情况就发生了变化。由于文官逐渐做大，五军都督府开始影响文官们掌权，所以文官集团开始想方设法的削减五军都督府的权利，并拆解其机构。
所以等到万历朝的时候，五军都督府实际上已经是名存实亡，就剩下一个牌子了。现在整个大明军队调遣部署等一系列工作全部由兵部一把抓。如果不是刘昊嘉用锦衣卫的名义编练了一支新军出来，他根本就没有跟文官集团掰手腕子的能力。稍有异动就会被文官吃得死死的！
万历帝得了这个良方妙法之后高兴至极，但是随即脸上的笑容就消失了，变得愁眉苦脸起来！他皱着眉头说道：“若是重立五军都督府的话，内阁那一关就绕不过去呀！不说别的，光和兵部打嘴仗就有的难受了！”
郑贵妃说道：“万岁爷也是一时糊涂了！现在陛下跟文官们相争不都是为了大明这个国家嘛，只不过是大家都想说了算而已！所以在国事上肯定还是有商量的余地。而且说不定文官这时候也巴不得缓和跟万岁爷的关系呢！这国事啊，在臣妾看来就跟调教宫人差不多，犯错误了要打，做对了事要赏！”
万历帝点点头说道：“爱妃说得对！朕要抽个时间跟几位阁老好好聊聊！”
郑贵妃太了解万历帝了，所以对他的能力根本不抱什么信心。于是她直接拉住万历帝的手臂说道：“万岁爷，和内阁的那群老狐狸聊天儿可不是您的长处，您只要跟首辅一个人说就可以了！”
万历帝连连点头答应下来，这时候他终于想起来他面对那几个阁老的时候从来没占过我便宜。只有单对单的时候，他依靠身份才能占据一丝上风！但凡他面对两个人以上都会吃亏！
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