而是在后来才逐渐设立，所以崇明新军在其基础上保留了最基本的伍、队、哨、营着四个构成，然后在其上又设置了团、师、军三阶，各阶军事主官统一称“长”，同实职类同，但仅限于新军内部。
这种方式，也是朱怡成用来打造新式军队的一个试点。从这七阶来看，几乎相等于近代军队组成结构了。其中伍是最基础机构，顾名思义一般以五人组成，而队就等同于后世的班，哨为连，营团等同后世相等，张昭身为守备，又授承信校尉，是一团之长，其部约四千人左右，三团为一师，二师为一军，再加一个炮团，全军二万五千人。
整支部队的火器比例高得惊人，除去新军中每团中各有一营暂时保留冷兵器外，其余全部由火器组成。普通战兵均持有火枪，而且这些火枪已从最初的火铳逐渐更换了最新研制出来的带有膛线的隧发枪，这种枪在后世也被称为来福枪或者来复枪。
这种火枪精度高，射程远，威力大。相比现在明军所装备的火铳而言强大许多，可这种枪也有着它的缺点，主要是因为其膛线构造，弹子装填比较麻烦，装填时需用工具进行辅助，所以其射速要低于目前的火铳。
不过在经过一系列调整，并且对装填和弹子的改造后，实施了定装弹和基础装填步骤，其射速已提高不少，经过严格训练的士兵，装填和发射速度差不多能和目前火铳相等。
根据小道消息，大明皇家科学研究所那边已经在想办法研制后装步枪了，如果这种步枪能制造出来，那么困扰新军的火枪装填速度就将彻底解决，但这种武器什么时候能够研制出来，这就不是张昭能知道的了。
除了火枪外，军中还装备了类似于万人敌的手持火雷，只不过这种东西在实用中效果不怎么样，一开始是用薄铸铁做的外壳，可十回有八九回不是炸不响要么就是炸了没效果。而后来改成了特殊陶瓷做的外壳，这一下倒是能炸响了，可因为材料不易运输，而且威力也不怎么样，所以军中很少使用，只留了一下作为储备而已。
在火枪之外，变化最大的就是火炮了。大明的冶炼工艺提升之后，新军的火炮完全取代了原来的火炮。
新式的佛朗机炮已成了各连的基础配备，每连都拥有四至五门佛朗机炮作为炮火支援，而在团一级中，除佛朗机炮外，还有十二门野战炮，按照送炮的人解释，这种炮叫六斤炮，因为这种炮有固定炮车，移动方便，炮火威力也不小，所以新军士兵大多把这种炮叫做“小六子”，十二门小六子一字排开，打出来的炮弹足以覆盖
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