进了司隶校尉阳球和中常侍王甫的朝廷争斗中，被人落井下石，在狱中遭受诘问责斥，不得不饮恨自杀，一代名将就此陨落。
前车之覆，后车之鉴。放弃如臂使指的军队，入朝去当一个名誉性的九卿高官，再一不小心卷入波谲云诡的朝廷争斗中，被那些口蜜腹剑的党人、宦官、外戚落井下石，落得一个身首分离、为天下笑的下场，这是董卓绝对不愿意看到的。
所以他当时接到征辟文书之后就立刻上奏回禀，让主笔的李儒在奏章中指出他麾下士卒对“牢直不毕，禀赐断绝，妻子饥冻”的不满愤恨，又特意含蓄提示当下将士们“泣挽臣车，使不得行。羌、胡憨肠狗态，臣不能禁止，辄将顺安慰。”的现状，最后来了一个总结，点明目前“凉州扰乱，鲸鲵未灭，此臣奋发暛命之秋。吏士踊跃，恋恩念报，各遮臣车，辞声恳恻，未得即路也。辄且行前将军事，尽心慰恤，暛力行陈。”
董卓回奏这封的奏章可谓开门见山，也不再是藏着捏着，他直接指出了朝廷封赏不行、麾下将士愤懑不满的现状，又特意提到自己在军中尽得人望，除了得军心的自己，没人能够安抚好麾下这些已经蠢蠢欲动的秦、胡之兵，最后就是告诉朝廷上的诸公，现在的凉州叛乱还没有被平定，自己身负皇恩，只能够奋发用命，致力于兵事，不能够接受征召回京。
董卓有所依仗，也就态度明确，直接点明厉害，拒绝了这一封暗藏凶险的征召文书，而后面鉴于凉州的兵事未定，朝廷之上果然也就没有了后续动作。
事件的风波也就此平息。
可是董卓没想到，这凉州叛军一被击败，朝廷之上针对自己的舆论又再次兴起。并且这一次，朝廷不仅动作迅速，还转变了策略，想要将自己外调，派往并州围剿肆虐郡县的南匈奴叛军。
之前李儒已经跟董卓做过谋划，他们一方要面对当下的处境，有三策可行。其中上策就是驻守三辅，拥兵自重，观望事变，这无疑也是最适合董卓一方的。一方面，董卓出身凉州，在陇西临洮的汉人豪强、羌胡部落之中有着不小的威望，危急之时可以征召凉州的义从兵马，最不济也能够退往凉州保全家族。另一方面，董卓在三辅驻防多年，在军中也经营了不少时日，长安作为汉帝国的西都，位置显赫，关中沃野千里，也是帝王之基，董卓拥兵取之，可成霸业。
为此，董卓在战胜凉州叛军之后，还特意暗中示意李儒从俘虏营中，挑选一些叛军俘虏，化身变成流亡三辅的“流寇”，扰乱郡县，断绝道路，造成地方不靖的局
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