到九月中旬，江西、湖南和浙江三省的抵抗已经接近结束。
浙江巡抚伊龄阿是最先败下阵来的，因为得不到有效的助力，且被兰芳军队从海上强袭杭州湾，直接攻克了杭州，致使全省指挥系统中枢最先崩溃。
大量浙江高官在杭州被兰芳军队俘获、击杀，伊龄阿本人勉强逃跑之后被兰芳军队紧追不舍，三日后被兰芳军队追上，混战之中中枪毙命。
伊龄阿死后，浙江绿营兵彻底没有了总指挥，只能各自为战，被兰芳军队集中主力各个击破，遂全面溃败，一发不可收拾。
随后，两湖总督毕沅和湖南巡抚浦霖联手发起的抵抗作战也宣告失败了，但是这不能怪毕沅。
毕沅已经竭尽全力，甚至调遣湖北绿营兵一部南下湖南支援浦霖的军队。
但是因为清廷分兵布防的政策，以及没有得到朝廷授权的事实，使得毕沅和浦霖始终无法调集兵力面对兰芳的优势兵力进攻，遂屡屡落败。
各地军队、官员也对兰芳军队的迅猛进攻感到惊恐，怯战者很多，毕沅竭尽全力安排军队，做出布防，却因为地方官员的消极对待而屡屡失败。
最后，浦霖感到惊恐，弃战而逃。
毕沅独力难支，也随后奔逃，逃回了湖北。
九月中下旬，开战之后约两个月，湖南的抵抗宣告失败，兰芳军队席卷湖南，带清政府最重要的粮食生产基地就此落入兰芳的掌控之中。
再接着是江西，被弘历评价为最为无用的两支绿营兵之一在应对兰芳军队的迅猛突袭时也不负众望的表现拉跨，只知道逃跑，不知道作战。
以至于进攻人数只有两万人的兰芳军队在面对三万多江西绿营的时候居然也是处处以多打少的局面，清军明明人数更多，却总是无法对兰芳军队形成优势兵力。
本来训练和武器装备就远远不如了，现在连人数优势都没有了，还怎么打？
江西巡抚何裕城倒是想要作战，奈何军队非常拉跨，江西之地也缺少八旗军队打头阵。
在南昌府作战的时候，何裕城派遣副将刘汉出击，结果刘汉临阵脱逃，带着亲兵一溜烟跑走了，不知所踪，军队旋即崩溃。
何裕城气急，在南昌府告急的时候决定身先士卒、亲自率领军队出击，结果还没开始作战，兰芳军队不过一轮枪击，绿营兵就崩溃了，争先恐后的奔逃，根本不管他们的巡抚大人。
最后只剩下何裕城和自己的亲兵被兰芳军队包围。
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