艾伦在潜入马莱后，逐渐知道了真相，也再次和莱纳相见。
长期被愧疚和压力折磨的莱纳跪倒在艾伦面前忏悔，请求艾伦杀掉他。
艾伦似有和解原谅之意，但听着窗外戴巴将艾伦·耶格尔指责为祸乱之源的慷慨演讲，艾伦还是决定要战斗到底。
于是艾伦变身巨人，大闹演讲会场，杀死了威利及在场众多政要和平民。
此时戴巴家族真正的巨人之力持有者——威利之妹变身“战锤巨人”与艾伦交战。
预先潜入的调查兵团，马莱方的野兽巨人，车力巨人，颚之巨人和战士队队长迪奥·马加特的部队纷纷现身参战。
阿尔敏则是在马莱港口变身超大型巨人的爆炸摧毁了马莱舰队，断了收容区内马莱军的后援。
激战后艾伦找出了战锤巨人的本体，但其被保护在和阿尼相同的高硬度水晶中无法吞噬。
战斗中艾伦发现颚之巨人的牙和爪能够破坏水晶，在米卡莎的配合下用颚之巨人之牙作夹子咬碎了水晶，得以吞噬战锤巨人。
另一边野兽，车力巨人也在兵团的围攻下败下阵来。
这也让后面被对艾伦的虐杀满怀仇恨的贾碧差点杀害的莎夏，得以吞噬被水晶一直护住的阿尼，最终成为女巨人之力的拥有者活了下来。
而后是第二次帕拉迪岛内乱，艾伦差点身死。
而赶在艾伦完全死亡之前，作为哥哥的兽之巨人吉克伸手接住了艾伦的头颅，始祖巨人和王血巨人的接触终于完成。
艾伦的意识在一处异空间内苏醒，在那里等着的的是被锁链束缚在地上，须发皆长的吉克，以及一根通天光柱。
他见到了巨人始祖尤弥尔，了解了这位先祖悲惨的过去。
后来艾伦不惜折断手指挣脱锁链，追上并抱住了尤弥尔。
告诉生前死后都自甘为弗里茨王室奴役的尤弥尔有自己决定力量和命运的权利。
现实中，时间仍停留在吉克接住艾伦头颅的瞬间。
艾伦的身体和头颅之间伸出一道脊椎状物将断掉的头身相连，接着艾伦开始再度巨人化。
最后的最后，他选择的是……报仇雪恨，发动地鸣将马莱连同他和其他所有的巨人之力全都在这个世界上抹去。
始祖尤弥尔从而得到了自由，巨人之力从世上消失，阿尔敏等人恢复了记忆得知了一切的真相，并决定继承艾伦的遗愿。
米卡莎独自带着艾伦的首级去往故乡山
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