隋军在疏勒国中的大清洗引起疏勒政坛很大的震荡，但实际上并不影响底层百姓的生活。
秦琼很清楚，对待这些番人，要“打一棒给个甜枣”，于是在清洗之后，先是减免疏勒国中百姓一年的赋税，又废除了阿弥厥当政其间的苛政、暴政，并处置了一批基层民怨极大的贪官污吏。老百姓可不管当权的是谁，就看谁给你带来好处，于是隋军很快便得到疏勒国百姓的拥戴。
到了这个时候，大隋根本不需要扶植代理人，而是直接赤膊上阵。
大清洗没涉及到阿弥厥，但整个疏勒王室也被清洗个七七八八。
秦琼以帮助阿弥厥学习大隋文化为由，将阿弥厥一家送往轮台，包括其他一些不适合清除但也不适合留在疏勒的人员，全部送往轮台。与其他几个送到轮台的国王一样，以后他们再也回不到疏勒了。
阿弥厥此时是砧板上的鱼肉，任人宰割。而且阿弥厥也不是什么有气节的君主，再是无奈忿恨，但为了保住小命，只得听之任之。
处置完疏勒王室，隋军在在其地堂而皇之地设置官府。黄明辽从都护府下令，将疏勒国分置达满、演渡、遍城三县，并置疏勒军镇，以秦琼兼任镇戍使，置兵八千人。
西域三镇安抚招讨司随之改为西域四镇安抚招讨司。
疏勒军镇西北从北疏勒山口通往热海，西面则是葱岭阻隔河中和吐火罗，西南则可通过大小罽宾（迦湿弥罗）进入天竺诸国，东南则可直达女国，可谓是西域的要道。
整个西域的贸易，都要从这里经过。
大隋控制了这里，西可进入河中，威胁西突厥腹地；西南可连接吐火罗，绕开西突厥，直接与波斯等国联系；南可进入天竺，开拓南亚次大陆；东南可进入羌塘之地，威胁未来将要崛起的吐蕃。
最最重要的是，大隋在天山以南的防线，最关键的西面一环，彻底闭环了。
秦琼占领疏勒之后，身边便还剩两个小国，一个是朱俱波，另一个则是喝盘陀。
朱俱波在疏勒的东南方向五百里，亦名朱居盘国，汉代时叫子合国，乃西域古国。现在的朱俱波是北凉诅渠家族之后所建，王为疏勒人，都叶城（今新疆叶城县），算是疏勒、于阗的一个共同属国。不过朱俱波国势不弱，有兵上千人，而且其国受西突厥影响很大，国内上下皆是亲西突厥派掌权。
大隋占领疏勒之后，晓谕四方。朱俱波却因为政治倾向，故意不与大隋接触。
秦琼乃派使节前往朱俱
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