其中，第一军因为要防备河南的李自成趁机南下湖北，以及随时入川支援正被张献忠二十万大军围攻的秦良玉，所以只能出动一万人，负责清剿整个湖北和庐州等地。
第一军负责的区域虽然很大，但湖北因为曾被左良玉肆虐，士族豪强等损伤很重，加上朝廷曾迁移数百万北方难民过去，又进一步的挤压了当地的士族豪强们的势力，所以此次湖北趁乱起兵的人数远远少于各省，只汇聚了一支不到四万人的反军，应龙军第一军很容易就能将之击溃，到时候进军庐州等地不成问题。
第二军在山东济南，一直防备着清军，虽然多尔衮此时已经带着满八旗去平叛蒙古了，但清军还有几十万汉旗军，为了预防多尔衮让他们南下捣乱，第二军只能出动六千人左右，负责清剿山东以及配合身在淮安的第七军清剿江淮沿海等地。
第三军在广州，负责清剿两广。
第四军在杭州，负责清剿浙江福建两省。
第五军仍留在京师南京城，暂不外掉。
在湖南长沙的第六军则直接离开湖南，进入江西，直扑正在猛烈攻打九江的福王，而湖南则留给同样在湖南的第八军清剿。
各军当中，朱慈烺最担心的是牛永胜的第六军是否能够胜任，毕竟第六军的军长牛永胜的资历和实战经验都是应龙军几个军长中最低的，并且从未独当一面过，这一次直接让他面对兵力众多的福王，实在有些勉强。
“皇上，福王大军已达到三十万，实力比潞王强大不少，是各路反军当中最强大的，依臣看，仅仅是让第六军两万人去面对，以一对十五，太过悬殊了，总有些令人担忧，是否让武昌的第二军暂且先放下湖北和庐州等地，南下与第六军汇合，一同在九江夹击福王。”朱慈烺说完自己的设想后，李岩觉得有些不妥，提出自己的建议道。
第六军若是与第二军一部一同夹击福王的话，便能将比例缩减至一对十，以应龙军当前的战力，到不至于那么令人担忧了。
“不，第六军或许不一定能击败福王的三十万反军，但在那群乌合之众面前自保却绰绰有余，牛永胜也该独当一面一次了。当年朕能带着三万应龙军正面击溃左良玉的三十几万精锐，而今应龙军实力比当年大增，福王大军又是一群临时组建的乌合之众，不过是看着人多罢了，比当年的左良玉差太多了，若是牛永胜带着第六军连自保都做不到，那他也没资格做应龙军的军长的，这就算是朕给他的一次考验吧！”朱慈烺摇了摇头，平静的说道。
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