第一代的X战警基本上都是由教授一手带大的，琴也并不例外，种族阵营的突然转变，让他们与原生家庭皆产生了无法弥补的深深裂痕。
从觉醒能力开始，学院就成为了他们停留时间最长的地方，对于占据主意识的琴来说，教授亦师亦父，但对于一直被封闭在心灵囚笼的凤凰人格而言，教授无疑是最值得她憎恶的敌人了。
憎恶之中还混杂着一丝微不可察的恐惧，她不想再回到那暗无天日的囚笼内部了。
也正是因为这份恐惧之情，所以琴在阿尔卡利湖下方消失了三年。
当凤凰之力在生死危机面前冲破堤坝与彻底琴融合时，那所谓的洪水对她已经造成不了什么威胁了，她完全可以从容地隔绝洪水后再行离开，但她没有这么做，并且刻意控制住了同行具备瞬移能力的变种人，防止对方在关键时刻去挽救她。
就这样，三年前所有X战警都逃出了生天，唯独她被洪水完全吞没。
在这三年间，她一边用心灵力量主动屏蔽了教授的感知，一边努力促进着凤凰之力与身体的深度融合，期间凤凰人格也在对主意识不断地进行着侵染覆盖，意图彻底掌控身体。
而现在，她已经接近成功了，琴即将变成真正的凤凰。
在之后的剧情中，完成了人格覆盖的凤凰用心灵感知诱导着斯科特再度来到她沉睡的阿尔卡利湖畔，并趁机将其直接吞噬。
凤凰之力的本质很高，但被封印二十年才重新挣脱了束缚后的她很虚弱，也很饥饿。
这种状态下的凤凰是无法与教授对抗的，她需要补充能源，而双眼拥有近乎无穷能量的斯科特，也就成为了当下最为合适的能量源。
于是镭射眼斯科特就成为了凤凰出世的第一个祭品，紧接着第二个便是X教授，意图重新封印凤凰人格的查尔斯，被盛怒状态下的她当场撕碎为漫天齑粉.
那是真正意义上的肉体灰飞烟灭，只有意识通过强悍的心灵力量勉强逃了出来，下线了很长时间才通过夺舍植物人的方法重新复活。
另一边，在杀死了教授之后，失去所有束缚的凤凰甚至产生了灭世的疯狂念头，一座岛屿在她操纵分子的能力下缓缓湮灭，无数人类和变种人在波及中被强行化为齑粉。
最终时刻，是金刚狼凭借着强横的自愈能力，在主意识琴的刻意放水之下，成功硬扛着肆虐的凤凰之力，亲手用钢爪插入了琴的心脏，了结了对方的性命。
至此，X战警实力大损，近乎半废，
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