这里的馆藏不但丰富，而且馆藏的历史还具备连续性。
三峡地区的博物馆里，都有大量的化石，包括步氏巨猿、中国乳齿象、先东方剑齿象、剑齿虎、双角犀、小种大熊猫等上百种。
最重要的是在巫山龙骨坡发现的一段化石，是国内发掘出的最早的人类，距今约两百万年，后来修正到两百一十四万年，被命名为“巫山人”。
鄂省这边，则出了“郧县人”，而且是两具较为完整的头骨。
郧县人的重要性在于，人类进化到直立人的时间阶段，是距今三十万年到两百万年之间
在中国东亚这个区域，元谋人距今一百七十万年，蓝田人距今一百六十万年到一百二十万年。
北京人则距今八十万年。
郧县人出现后，大家发现他距今是一百万年左右，刚好填补上了东亚直立人在元谋人、蓝田人和北京猿人之间的长时段演化空白，具有不可替代的研究价值与地位。
等到进入旧石器时代已有，三峡文明从距今八千年到四千两百年间，一直没有中断过。
在这个“文明走廊”里，先后发现了距今约8000到7000年前的楠木园文化，7000到6000年前的柳林溪文化，6200到5000年前的大溪文化，5000到4500年前屈家岭文化，4500到4200年前石家河文化庙坪类型。
等到进入先秦，春秋，战国……文化遗存和文物发现就越来越多了。
而且在这期间，能够发现许多文化融合与征服的证据，以及考古中一个非常重要的学问分支——比较学。
比如小田溪巴王编钟，整体风格是楚式的，但又在装饰上呈现出巴文化特点。编钟木架两段及立柱顶部不是楚人崇尚的凤鸟，而是虎头形的装饰。
又比如两族民风民俗、服饰有许多相似之处，两族都善渔猎；两者都善于制作竹器，漆器；楚人好巫术，而巴人信鬼神。
到了后期，两者渐渐开始融合，各地出土的战国时期文物里，往往就有“虎座立凤悬鼓”，“卧虎立凤”这类漆木器，器物特征把巴楚文化风俗习惯混同的特点显露无遗。
然而更加有趣的是，楚文化中很多器物上都是凤鸟踩着老虎，而在巴文化中，虎是无比尊贵和崇高的，绝对不会让其他动物踩在虎上。这里边表现出来的，却是文化交融后发展的不同结果，以及民族的强弱。
之后就是两汉，三国……直到存放在这里的近代文物——在晚清闭
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